Различные комплексы сейчас аминокислот, БАДы, антиоксиданты – с ними как быть?

Это разные группы. Есть антиоксиданты, есть витамины, которые идут в совокупности с пробиотиками, например. Чтобы принимать пробиотики, нужно быть уверенным, что есть дисбактериоз. Есть факторы риска, например, аппендэктомия, удаление аппендицита, либо злоупотребление алкоголем или злоупотребление различными препаратами, в том числе приём нестероидных противовоспалительных препаратов. Злоупотребление жирной пищей, фастфудом может привести к дисбактериозу и витамины усваиваться не будут. Но во всех остальных случаях, если человек разнообразно питается, если у него нормальная работа кишечника, нет проблем, то пробиотики принимать не нужно. У человека есть свои запасы, микрофлора кишечника сама восстанавливается. Дисбактериоз можно выявить с помощью диагностики, сдать кал на определение бактериального фона. Если проблем нет, то микрофлора восстановится. 

– Либо можно дополнить теми же йогуртами. 

Йогурты, которые «не все одинаково полезны», не содержат в нужном объёме бактерии. А те бактерии, что содержат, к сожалению, пройдя через желудок и кишечник, переходят в инактивированную форму, никаким образом не влияют на микрофлору. Поэтому на них рассчитывать не стоит.